Ürünler

Hepatit C virüsü (HCV), otoimmün hepatit (AIH) ve primer biliyer siroz (PBC) gibi sirozlu karaciğer hastalıklarındaki patojenik moleküler yollar zayıf bir şekilde karakterize edilmiştir.Diferansiyel olarak eksprese edilen genler genellikle hastalık patogenezinde önemlidir.Bastırma çıkarıcı hibridizasyon (SSH), diferansiyel olarak ifade edilen mRNA transkriptlerini zenginleştiren genom çapında bir yaklaşımdır.Kantitatif gerçek zamanlı ters transkriptaz polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR) ile birlikte SSH kullanarak sirozda diferansiyel gen ekspresyonunun yeni gözlemlerini yapmayı amaçladık.HCV sirozu, AIH sirozu, PBC ve hastalıksız karaciğer dokusundaki karaciğer transkriptomları SSH ile incelendi.Ortaya çıkan tamamlayıcı DNA (cDNA) klonları, nokta leke hibridizasyonu ile diferansiyel ekspresyon için yeniden tarandı ve ardından sekanslandı.Seçilen gen ifadesi, gerçek zamanlı RT-PCR ile ölçüldü.SSH'nin ardından 694 klon, diferansiyel gen ekspresyonu için yeniden tarandı, bunlardan 145'i sekanslandı ve 89 farklı genden türediği bulundu.Yedi klon, yalnızca bilinen bir işlevi olmayan genleri kodlayan eksprese edilmiş dizi etiketi (EST) dizileri ile homolog olmuştur.Dört genin yukarı regüle edilmiş ekspresyonu, gerçek zamanlı RT-PCR ile doğrulandı: tüm siroz formlarında transmembran 4 üst aile üyesi 3 (tetraspanin CO-029), AIH sirozunda kirpi etkileşimli protein (HIP) ve kitinaz 3-benzeri-1 (HC gp-39 veya ykl-40) ve arginin-glutamik asit tekrarı (RERE) HCV sirozunda.İncelenen tüm dokularda RERE gen polimorfizmleri ve splice varyantları gözlendi.Tetraspanin CO-029 yukarı regülasyonu birincil olarak safra kanalı hücrelerinde lokalize olmuştur.Sonuç olarak, birincil keşif aracı olarak SSH kullanılarak insan sirozunda diferansiyel gen ekspresyonunun yeni gözlemleri yapılmıştır.Özellikle, HCV ile ilişkili karaciğer hastalığında RERE geni ve ürünlerine ilişkin daha ileri çalışmalar garanti edilmektedir.