Ürünler

Kızılötesi spektroskopi, substrat-protein etkileşimlerinin haritasını çıkarmak için kullanılmıştır: nükleotit bağlanması ve ATPaz fosforilasyonu üzerine sarkoplazmik retikulum Ca(2+)-ATPase'in konformasyonel değişiklikleri, substrat ATP ve ATP analogları (2'-deoksi-ATP, 3) kullanılarak izlendi. '-deoksi-ATP ve inosin 5'-trifosfat), substratın spesifik fonksiyonel gruplarında modifiye edilmiştir.2'-OH, 3'-OH ve adenin amino grubuna yapılan modifikasyonlar, son ikisi için gözlemlenen özellikle güçlü etkilerle ATPaz'ın bağlanma kaynaklı konformasyonel değişikliğinin derecesini azaltır.Bu, nükleotit-ATPaz kompleksinin, nükleotid ve ATPaz arasındaki bireysel etkileşimlere karşı yapısal duyarlılığını gösterir.Çalışılan tüm gruplar, bağlanma için önemlidir ve belirli bir ligand grubunun ATPaz ile etkileşimleri, diğer ligand gruplarının etkileşimlerine bağlıdır.ATPaz'ın fosforilasyonu, ITP ve 2'-deoksi-ATP için gözlendi, ancak 3'-deoksi-ATP için gözlenmedi.Nükleotit bağlanması üzerindeki konformasyonel değişikliğin kapsamı ile fosforilasyon hızı arasında doğrudan bir bağlantı yoktur; bu, ATP'nin neden olduğu konformasyonel değişikliğin tüm kapsamının fosforilasyon için zorunlu olmadığını gösterir.Nükleotid-ATPase kompleksi için gözlemlendiği gibi, ilk fosforile edilmiş ATPase ara ürünü E1PCa(2)'nin konformasyonu da nükleotide bağlıdır, bu da ATPase durumlarının daha önce tahmin edilenden daha az üniform bir konformasyona sahip olduğunu gösterir.