Ürünler

Bir insan bağırsağı ortakyaşamındaki Ca2+ bağımlı bir alfa-mannosidaz ailesine ilişkin mekanik içgörüler.

Bacteroides thetaiotaomicron tarafından örneklenen kolonik bakteriler, diyet polisakkaritlerini ve konakçı glikanları besin olarak kullanmak için büyük glikozid hidrolaz (GH) ailelerini kullanarak insan sağlığının korunmasında önemli bir rol oynar.Bu tür GH ailesi genişlemesi, B. thetaiotaomicron genomu tarafından kodlanan 23 aile GH92 glikosidazlar tarafından örneklendirilir.Burada bunların, konakçı N-glikanları kullanmak için tek bir yer değiştirme mekanizması yoluyla hareket eden alfa-mannosidazlar olduğunu gösteriyoruz.İki GH92 mannosidazın üç boyutlu yapısı, bir Ca(2+)-'de hidrolize asit (glutamat) ve baz (aspartat) yardımı sağlayan, katalitik merkezin alan arayüzünde bulunduğu iki alanlı bir protein ailesini tanımlar. bağımlı bir şekilde.GH92'lerin inhibitörlerle kompleks halindeki üç boyutlu yapıları, katalizin özgüllüğü, mekanizması ve konformasyonel güzergahı hakkında bilgi sağlar.Ca(2+), mannosidi taban durumundan (4)C(1) sandalye konformasyonundan geçiş durumuna doğru deforme etmeye yardım etmede önemli bir katalitik rol oynar.（Kaynakça: Nat.kimyaBiol.6, 125-32, (2010)

Bir konkanavalin A-sefaroz kolonu üzerinde ovalbümin glikoasparaginlerin ön afinite kromatografisi.Lektinin bağlanma özgüllüğüne ilişkin kantitatif bir çalışma.

Sepharose 4B ile immobilize edilmiş konkanavalin A'nın (ConA) ovalbümin'den türetilen 10 glikoasparajin ile etkileşimleri, frontal afinite kromatografisi ile kantitatif olarak araştırıldı.Bu yöntemde, bir ConA-Sepharose kolonuna sürekli olarak bir karbonhidrat çözeltisi uygulanır ve elüsyon cephesinin gecikmesi, etkileşimin gücünün bir parametresi olarak ölçülür.ConA'lı her sakkarit için ayrışma sabiti (Kd) belirlenebilir.p-nitrofenil-alfa,D-mannosidin bağlanmasına ilişkin bir analiz, ConA'nın bağlanma özelliklerinin Sepharose 4B üzerinde immobilizasyondan sonra esasen değişmediğini göstermiştir.Ovalbümin glikoasparajinlerin her biri, analiz için indirgeyici metilasyon yöntemiyle trityum ile etiketlendi.Elde edilen Kd değerlerinin karşılaştırılması, ConA'nın bağlanmasının, glikosil zincirinin çok hafif yapısal farklılıkları ile önemli ölçüde değiştiğini göstermiştir.Sonuçlar, ConA'nın, C-6'ya bağlı mannozun C-3 pozisyonunda en az bir hidroksil grubunun serbest olması gereken Man alfa 1-6(Man alfa 1-3)Man adlı spesifik bir glikosil zincir yapısını tanıdığını göstermektedir.