Ürünler

İlaca bağlı karaciğer hasarı, ilaç yıpranmasının ana nedenlerinden biridir.İlaç adaylarının karaciğer etkilerini kimyasal yapılarından tahmin etme yeteneği, deneysel ilaç keşif projelerini daha güvenli ilaçlara yönlendirmeye yardımcı olmak için kritik öneme sahiptir.Bu çalışmada, insanları, kemirgenleri ve kemirgen olmayanları içeren farklı türlerde karaciğerde çok çeşitli etkiler ürettiği bildirilen 951 bileşikten oluşan bir veri seti derledik.Bu veri seti için karaciğer etkileri, sözcüksel ve dilbilimsel yöntemlerin ve ontolojik kuralların benzersiz bir kombinasyonu kullanılarak MEDLINE özetlerinden oluşturulan iddialı meta veriler olarak elde edildi.Bu veri setini geleneksel keminformatik yaklaşımları kullanarak analiz ettik ve karaciğer etkilerinin türler arası uyumu, insanlarda karaciğer etkilerinin kimyasal belirleyicileri ve belirli bir bileşiğin insanlarda bir karaciğer etkisine neden olup olmayacağının tahmini ile ilgili birkaç soruyu ele aldık.Farklı türler arasında karaciğer etkilerinin uyumunun nispeten düşük olduğunu (yaklaşık %39-44) bulduk, bu da tür özgüllüğünün kimyasal yapının belirli özelliklerine bağlı olabileceği olasılığını artırıyor.Bileşikler, kimyasal benzerliklerine göre kümelendi ve benzer bileşikler, türe bağlı karaciğer etki profillerinin beklenen benzerliği açısından incelendi.Çoğu durumda, aynı kümenin üyeleri için benzer profiller gözlendi, ancak bazı bileşikler aykırı değerler olarak göründü.Aykırı değerler, diğer veri kaynaklarının yanı sıra MEDLINE'ın odaklanmış iddia yenilemesine konu olmuştur.Bazı durumlarda, bileşiklerin kimyasal benzerliklerine dayanan beklentilerle uyumlu olan ek biyolojik iddialar belirlendi.İddialar ayrıca altta yatan kimyasalların ikili ek açıklamalarına dönüştürüldü (yani, karaciğer etkisi veya karaciğer etkisinin olmaması) ve bir bileşiğin insanlarda karaciğer etkileri üretmesinin beklenip beklenmeyeceğini tahmin etmek için ikili nicel yapı-aktivite ilişkisi (QSAR) modelleri oluşturuldu.Verilerin görünürdeki heterojenliğine rağmen, modeller, harici 5-katlı çapraz doğrulama prosedürleri tarafından değerlendirilen iyi tahmin gücü göstermiştir.İkili QSAR modellerinin harici tahmin gücü, model geliştirildikten sonra alınan veya incelenen bileşiklere uygulanmasıyla daha da doğrulandı.Bildiğimiz kadarıyla bu, QSAR modellemesini ve diğer keminformatik tekniklerini, sınırlı manuel düzeltme ile otomatikleştirilmiş metin madenciliği yoluyla üretilen gözlemsel verilere uygulayan ve kimyasal toksikoloji oluşturmak ve modellemek için yeni fırsatlar açan ilk kimyasal toksisite tahmini çalışmasıdır. veri.